Тиббиёт фанлари доктори, парҳезшунос Маргарита Королёванинг айтишича, аутоиммун касалликларида бақлажонни кўп истеъмол қилиш мумкин эмас. Аутоиммун касалликларига тиреоидит, шунингдек, бўғимлар ва ичак касалликлари киради. Аллергияда бақлажонни умуман камроқ истеъмол қилмаган маъқул.
Бақлажон таркибидаги моддалар яллиғлантирувчи хусусиятларга эга. Ичак касалликларида бақлажон уруғлари шикастланган жойга кириб, ичак саломатлигига салбий таъсир қилиши мумкин.
Мутахассиснинг сўзларига кўра, итузумдошлар оиласига мансуб ҳар қандай сабзавотлар (бақлажон, помидор, булғор қалампири) агар мунтазам истеъмол қилинса, яллиғланиш касалликларига сабаб бўлиши мумкин.